Dekanat Larantuka

• Paroki Katedral Larantuka – Renha Rosari
• Paroki Belogili – St. Herman Josef
• Paroki Hokeng – Sta. Maria Ratu Semesta Alam
• Paroki Kalike – St. Mikhael
• Paroki Lato – Sta. Perawan Maria La Salette
• Paroki Lebao Tengah – San Juan
• Paroki Lewokluok–Bama – Sta. Maria Diangkat ke Surga
• Paroki Lewolaga – Sta. Maria Immaculata
• Paroki Leworahang – St. Antonius Padua
• Paroki Lewotala – St. Alfonsus de Liguori
• Paroki Lewotobi – St. Yoseph
• Paroki Menanga – St. Fransiskus Xaverius
• Paroki Pamakayo – Kunjungan Sta. Perawan Maria
• Paroki Riang Kemie – St. Yoseph
• Paroki Riangpuho – St. Darius
• Paroki Ritaebang – St. Yohanes Pembabtis
• Paroki Waibalun – St. Ignasius
• Paroki Waiklibang – St. Ludovikus
• Paroki Watobuku – Kristus Raja Semesta Alam
• Paroki Weri – Sta. Maria Pembantu Abadi
• Paroki Kotenwalang – St. Paulus dari Salib

Dekanat Adonara

• Paroki Baniona – Sta. Maria Hati Tak Bernoda
• Paroki Hinga – St. Martinus
• Paroki Kiwangona – Sta. Theresia dari Kanak-Kanak Yesus
• Paroki Koli–Sagu – St. Petrus
• Paroki Lamabunga – St. Werenfried
• Paroki Lite – St. Yoseph
• Paroki Pukaona – Sta. Bernadeth
• Paroki Ritawolo – Hati Kudus Yesus
• Paroki Tanah Boleng – St. Yoseph
• Paroki Waiwadan – Sta. Maria Goreti
• Paroki Waiwerang – Kristus Raja
• Paroki Witihama – Sta. Maria Bunda Pembantu Abadi

Dekanat Lembata

• Paroki Aliuroba – Sta. Maria Pembantu Abadi
• Paroki Boto – St. Yoseph
• Paroki Hadakewa – St. Laurensius
• Paroki Hoelea – Salib Suci
• Paroki Kalikasa – St. Antonius Padua
• Paroki Lamahora – St. Fransiskus Asisi
• Paroki Lamalera – St. Petrus dan Paulus
• Paroki Lerek – Hati Amat Kudus Yesus
• Paroki Lewoleba – Sta. Maria Banneux
• Paroki Lodoblolong – St. Wihelmus
• Paroki Minggar – Sta. Maria Ratu Damai
• Paroki Tokojaeng – St. Bernardus Abbas
• Paroki Waikomo – St. Arnoldus Jansen
• Paroki Waipukang – Sta. Maria Bintang Laut
• Paroki Wangatoa – Kristus Raja